Пользователи PETSc должны выполнять множество тестов. Например, существует большое количество опций для решателей линейных и нелинейных уравнений в PETSc, и различные варианты могут привести к большой разнице в скоростях сходимости и времени выполнения. PETSc использует значения по умолчанию, которые в общем случае подходят для широкого круга задач, но ясно, что эти значения не могут быть наилучшими для всех случаев. Пользователи должны экспериментировать с множеством комбинаций, чтобы определить наилучшую для конкретной задачи и соответствующим образом настроить решатель. Для этого необходимо, в частности: